病原体とファージの地理的マッピングによる薬剤耐性克服

薬剤耐性菌の増加を受け、治療薬としてのバクテリオファージへの関心が高まっている。しかし、ファージ耐性病原体の出現はファージ療法の課題となる。ファージ療法のボトルネックは、耐性病原体に対する病原性ファージの発見にある。従来の発見方法は時間と労力がかかり、バイアスも存在するため、候補ファージの特定が困難であった。この課題を克服するため、小容量環境サンプリングと16S rRNAシーケンシングを組み合わせ、細菌宿主とその捕食者ファージが共存するリザーバーを特定する「地理的ファージマッピング(geΦmapping)」を開発した。さらに、ポータブルなファージ探索デバイス(ΦHD)を開発し、リザーバーから直接濃縮されたファージを得ることを可能にした。geΦmappingと高スループット濃縮を統合することで、新規ファージの多様なコレクションであるRΦライブラリを構築した。従来のファージ探索や実験的進化アプローチが失敗したESKAPE病原体群に対し、極めて耐性の高い生物を標的とする36種の新規ファージを単離・取得した。