ヨーロッパコウモリイカ Sepia officinalis の染色体スケールゲノムアセンブリ
Chromosome-scale genome assembly of the European common cuttlefish Sepia officinalis
コウモリイカ科のモデル生物であるヨーロッパコウモリイカ(Sepia officinalis)の染色体スケールゲノムアセンブリが完了した。アセンブリは5.68ギガ塩基対に及び、47個の繰り返し配列に富む染色体スケール足場から構成される。これは他の十脚目のハプロイド核型が46本の染色体を示すこととは異なるが、既存のゲノムアセンブリとの詳細な比較により、46個の足場間に明らかな相同性が示された。この結果は、S. officinalis の真の核型が1n=46であり、十脚類において祖先的かつ保存されている可能性が高いことを示唆している。本研究では、包括的な遺伝子アノテーションと全長の転写産物予測も行われ、軟体動物間の相同遺伝子ファミリーの特性評価に用いられた。特に頭足類に特異的な大規模な遺伝子群の拡大が確認され、成体のS. officinalis の神経組織および非神経組織に特異的な遺伝子も多数同定された。このゲノムは、頭足類の進化、脳構造、情報処理、発生、行動に関する将来の研究に貴重なリソースとなるだろう。
- ヨーロッパコウモリイカ(Sepia officinalis)の染色体スケールゲノムアセンブリが完了した
- 頭足類に特異的な大規模な遺伝子群の拡大が確認された
ヨーロッパコウモリイカ(頭足類)の染色体スケールゲノムアセンブリが完了した。頭足類は神経系の複雑さや情報処理能力が際立つ生物群であり、そのゲノム基盤の解明は脳科学・AIアルゴリズム研究への応用可能性を秘める。また、頭足類特異的な大規模遺伝子群の拡大が確認された点は、創薬標的や合成生物学の新たなモジュール開発につながる可能性があり、長期的にバイオテクノロジー領域の投資テーマとして注目に値する。ただし、現時点では基礎研究段階であり、実用化には時間を要する点に注意が必要。