エクソームベースのがんドライバー遺伝子網羅的検査は、トリプルネガティブ乳がん患者に遺伝学的診断を提供可能
Exome-based cancer driver gene comprehensive testing can provide a genetic diagnosis for individuals with triple-negative breast cancer
トリプルネガティブ乳がん(TNBC)は、攻撃的な挙動、高い腫瘍の不均一性、再発・早期転移の可能性の高さが特徴であり、治療を困難にしている。本研究では、TNBC患者24人を対象に、全エクソームシーケンシング(WES)とがん感受性遺伝子(CSG)におけるバリアント優先順位付けを検証した。再現可能なバイオインフォマティクスパイプラインを開発し、既知の遺伝性がん症候群の分子診断を持つ25人を対象に技術検証を行った。TNBC発見コホート(患者の12.5%)で包括的ながん遺伝子パネルを確立し、ATM、RAD51D、BRCA1遺伝子における3つの病原性生殖細胞系列バリアント(gPV)を特定した。これらの遺伝子はDNA修復の相同組換え(HRD)経路に関与している。開発されたパイプラインは、TNBC患者だけでなく、遺伝的要因が疑われるあらゆるがん患者の遺伝性がんリスク症候群の遺伝学的診断に適用可能であることが示された。
- TNBC患者24人を対象に全エクソームシーケンシングとがん感受性遺伝子バリアント優先順位付けを実施し、患者の12.5%でATM、RAD51D、BRCA1遺伝子の3つの病原性生殖細胞系列バリアントを特定した
- 既知の遺伝性がん症候群の分子診断を持つ25人を対象に技術検証を行い、再現可能なバイオインフォマティクスパイプラインを開発した
エクソームシーケンシングを用いた生殖細胞系列がんドライバー遺伝子検査がTNBC患者の遺伝学的診断に有効であることを示した研究成果。BRCA1、ATM、RAD51Dなどの相同組換え修復経路遺伝子の病原性バリアントを特定しており、PARP阻害剤など標的治療の適用判断につながる可能性がある。診断パイプラインの拡張性は、遺伝性がん検査市場における臨床応用・商用化の余地を示唆しており、ゲノム診断企業や関連バイオ企業への投資判断に有用な情報。