ホルマリンフリーパラフィン包埋組織における良好なDNAおよび十分なRNAインテグリティ
Good DNA- and sufficient RNA integrity in formalin-free paraffin-embedded tissues
病理学分野では、がん診断の特異性向上や分子プロファイルに基づいた個別化医療に分子生物学が貢献してきた。しかし、従来の組織包埋技術ではホルムアルデヒドが使用され、DNAやRNAを損傷し、分子診断の質に影響を与えていた。今回、超臨界CO2を用いたホルマリンフリーの新しい組織包埋技術が開発された。この技術により、ホルムアルデヒドを使用せず、基本的な病理技術に適した高品質なサンプルが得られる。本研究では、この新しい技術で処理された組織(7年、2年、3日前)から単離されたDNAとRNAのインテグリティを分析し、ホルマリン固定組織と比較した。結果として、新しい包埋技術は、DIN値が高いことから、従来のホルマリン固定組織よりも高品質なDNAを生成することが示された。一方、RNAの品質(RIN値)は、3日および2年前の非固定組織(NFPE)ではホルマリン固定組織(FFPE)と比較して一般的に低かったが、7年前の組織では同等であった。3日、2年、そしてほとんどの7年前の非ホルマリン固定組織から単離されたRNAは、主要な下流分子技術である次世代シーケンシング(NGS)に適していた。
- 超臨界CO2を用いたホルマリンフリーの組織包埋技術により、DIN値が高く従来のホルマリン固定組織より高品質なDNAが生成された
- 非ホルマリン固定組織から単離されたRNAは、7年前の組織を含めて次世代シーケンシング(NGS)に適していることが示された
病理診断・分子診断領域における組織包埋技術の革新は、がん診断の精度向上と個別化医療の推進に直結する。ホルマリンを使わない新規包埋技術が従来法と同等以上のDNA品質を実現し、NGS下流解析にも適したRNAが得られたことは、分子診断市場の競争構造を変える可能性がある。病理診断サービスの高付加価値化や新規試薬・機器ベンダーの事業機会創出につながる技術として注目に値する。