ラトビアの入院児における肺炎球菌鼻咽頭カリエス、血清型分布、およびワクチン接種状況:PCV13後、PCV15/PCV20移行期の横断研究

• 本稿は小児肺炎球菌感染症向けAI診断の関連文献の範囲・性質をマッピングする系統的スコーピングレビューを提案し、併せて経済分析の枠組みを提示する。
• 既存の小児AI診断研究は、人口多様性の制限、サンプルサイズの小ささ、外部検証の欠如、標準化された報告の不在、プライマリケア・低資源環境を軽視した病院中心の焦点という欠点を抱える。
• 肺炎球菌感染症はワクチン普及後も小児の罹患・死亡の主因で、ワクチンアクセス・カバー率の制約、コールドチェーン制約、診断の遅延と不正確さが農村部・プライマリケア・低所得層に不均衡に影響している。

• 重症喘息児20名と非喘息児10名の気管支肺胞洗浄液(BAL)を解析し、重症喘息群でアクチノバクテリア門やストレプトコッカス属などの相対存在量が増加していた
• 重症喘息児のBALではアルギニンが減少し、スペルミン・スペルミジンが増加するポリアミン経路の変化が認められ、ストレプトコッカス属との有意な関連が示された
• マイクロバイオームとメタボロームの統合データにより、増悪頻度やアトピー性皮膚炎合併といった重症喘息の病型を識別できることが示された

本研究では、メタボロミクスを用いて小児敗血症の原因となる病原体間の代謝プロファイルの違いと潜在的なバイオマーカーを特定した。MetaboLightsデータベースから細菌性およびウイルス性小児敗血症の血清メタボロームプロファイルを収集し、主成分分析(PCA)や部分最小二乗判別分析(PLS-DA)を用いて代謝的差異を探索した。14個の差次的代謝物が同定され、主に窒素代謝、アルギニン生合成、アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸の代謝に関連していた。特に、コリン、グルタミン酸、グルタミンは細菌性小児敗血症とウイルス性小児敗血症の間で高い識別能力を示した。Extreme Gradient Boost…

• インフルエンザA/B型、RSV、ヒトライノウイルス、ヒトアデノウイルス、マイコプラズマ・ニューモニエの6病原体を同時検出する多重リアルタイムPCR+蛍光プローブ融解曲線(mqPCR-PMC)アッセイを開発・評価した
• 最適化したプライマーとプローブは57病原体パネルに対し100%の特異性を示し、検出限界は248〜394コピー/ml
• 760の咽頭サンプルでの臨床検証で、市販の蛍光RT-PCRキット比で各病原体につき感度87%以上・特異性99%以上、κ値0.927〜1.000

• 合成細菌コミュニティを気道に導入することで、バークホルデリア・タイランデンシス感染に対する予防的対抗策となることをマウスで実証した。
• プロバイオティクスと病原体間のニッチ重複がin vivoでのプロバイオティクス性能の指標となることを明らかにした。
• in vitroでの拮抗作用の理解がin vivoでの防御能力を持つプロバイオティクスの同定を導くことを示した。